Ухоженная шерсть чихуахуа — важный показатель здоровья и качества содержания. Структура шерсти во многом наследственная, однако неправильный уход, стресс и климат могут ухудшить её состояние. Поэтому регулярный уход за шерстью чихуахуа необходим как длинношерстным, так и короткошерстным собакам. В период подростковой линьки чихуахуа щенок меняет шерсть и может выглядеть неопрятно — это нормальный этап развития.
К уходу щенка приучают с 3 месяцев: мягкое расчесывание, сушка феном, поощрение лакомством. Нельзя дёргать шерсть — иначе чихуахуа шерсть колтунится, появляется страх перед процедурами. Для работы используйте качественную расчёску для чихуахуа: массажную щётку и гребень. Длинношерстных собак расчёсывают 2–3 раза в неделю, в период линьки — ежедневно; гладкошерстных меньше, но они тоже линяют и оставляют шерсть на одежде.